【最新版】中部地方のフリースクール助成金・補助金一覧｜不登校の利用料を抑える自治体まとめ

2025年11月18日2026年10月16日

※本記事の内容・金額は、2025年11月時点で各自治体のホームページを確認した情報をもとにしています。最新情報は必ず各自治体の公式サイトでご確認ください。

中部地方でフリースクールの助成金・補助金を探している保護者の方へ

不登校のお子さんを支援するためにフリースクールを利用する際、気になるのが「利用料」です。
フリースクールの費用は、公立学校と違い基本的には自己負担。通所型であれば交通費もかかり、家庭の経済的負担は決して小さくありません。

一方で、自治体によってはフリースクールの利用料や交通費を補助する「助成金・補助金制度」が整いつつあります。ただし、制度の有無や対象、金額は自治体ごとに大きく異なり、「自分の住んでいる地域ではどうなのか？」がとても分かりにくいのが現状です。

そこで本記事では、中部地方（愛知・新潟・長野・富山・山梨）を対象に、保護者が利用できるフリースクール助成金・補助金情報を一覧で整理しました。
「フリースクール　助成金（補助金）」「フリースクール　補助」「不登校　利用料」などで検索している方の、情報収集の手間を少しでも減らせればうれしいです。

フリースクールの利用料金と、助成金が必要な理由

フリースクールの利用料の相場は、地域や内容にもよりますが、通所型で月額3万〜7万円前後、オンライン型でも月1万〜3万円程度かかることが多いです。

さらに、通所型の場合は交通費、昼食費、教材費、イベント費などもかかるため、トータルの負担が大きくなりがちです。
そのため、自治体が行う「フリースクール補助」「フリースクール等利用支援」といった助成制度は、

不登校のお子さんが、自分に合った学びの場を確保し続けること
保護者の「不登校　利用料」負担を軽くすること

の両面で、とても重要な役割を果たしています。

小中学生の学びの選択肢

学び方、対象年齢、費用や在籍校との連携を公式情報で確認し、ご家庭に合うか比べてください。

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【最新版】中部地方のフリースクール助成金・補助金一覧

ここでは、中部地方のうち、実際にフリースクールの利用料や通所に対する助成金・補助金制度が確認できた自治体をまとめています。
各自治体ごとの「対象」「金額のイメージ」「リンク」を一覧からチェックできます。

※補助金額は「上限額」や「何割を補助」など自治体ごとに細かな条件があります。あくまで目安として記載し、詳細は必ず公式HPをご覧ください。

▼ 愛知県

自治体	制度名	対象者	補助内容	補助金額（目安）	リンク
豊田市	フリースクール等利用支援補助金	市内小・中・特別支援学校に在籍する不登校児童生徒の保護者等	フリースクール等の利用料・教材費・行事費などの一部を補助	児童生徒1人あたり月額上限2万円	公式HP
大府市	フリースクール等授業料補助金	大府市立小中学校に在籍し、長期欠席傾向にある児童生徒の保護者	フリースクール等に支払った授業料の一部を補助	授業料の2分の1（児童生徒1人につき月2万円が上限）	公式HP
みよし市	フリースクール通所にかかる交通費補助	不登校等によりフリースクール等へ通う児童生徒	フリースクール通所にかかる交通費の一部を補助	交通費の一部（上限・回数などの条件あり）	公式HP

▼ 新潟県

自治体	制度名	対象者	補助内容	補助金額（目安）	リンク
上越市	上越市フリースクール等利用支援補助金	市内の不登校状態にある小・中学生の保護者（所得要件あり）	入学費・寮費・学習費・食費など、フリースクール利用にかかる経費の一部を補助	利用開始時の入学費・入寮費、学習費・寮費・食費などについて負担額の1/2を補助（学習費は月2万円前後を上限とする区分あり）	公式HP

▼ 長野県

自治体	制度名	対象者	補助内容	補助金額（目安）	リンク
長野市	フリースクール等民間施設利用料助成事業	市内に住所があり、不登校状態にある児童生徒の保護者	フリースクール等民間施設の利用料の一部を助成	利用料の一部（年額・月額の上限あり）	公式HP
松本市	フリースクール等利用児童生徒支援事業補助金	フリースクール等に通う不登校児童生徒の保護者	フリースクール等の利用にかかる経費を補助	利用料の一部（上限額・対象経費に制限あり）	公式HP
諏訪市	フリースクール等にお通いの児童生徒のご家庭への補助制度	フリースクール等に通う児童生徒のいる家庭	フリースクール等の利用料の一部を補助	利用料の一部（世帯要件・上限あり）	公式HP
下諏訪町	フリースクール等利用児童生徒支援補助金	町内在住の不登校児童生徒	フリースクール等の利用料の一部を補助	利用料の一部（上限・期間に制限あり）	公式HP
高森町	フリースクール利用料補助金	町内在住の不登校児童生徒の保護者	フリースクールの利用料を補助	利用料の一部（児童生徒1人あたりの上限設定あり）	公式HP
野沢温泉村	フリースクール利用料等補助金	村内在住の不登校児童生徒	利用料や通所にかかる経費等の一部を補助	利用料・通所費用の一部（上限額あり）	公式HP

▼ 富山県

自治体	制度名	対象者	補助内容	補助金額（目安）	リンク
富山県	フリースクール等通所児童生徒支援事業	県内の学校に在籍し、フリースクール等を利用する児童生徒	フリースクール等で活動するために必要な経費（通所・オンライン利用を含む）の一部を補助	利用内容に応じて実費の一部を補助（詳細は事業概要・要綱で確認）	公式HP

※富山県は、オンラインでの利用も対象となる点が特徴です。

▼ 山梨県

自治体	制度名	対象者	補助内容	補助金額（目安）	リンク
甲府市	甲府市フリースクール利用支援事業費補助金	市内在住の不登校児童生徒	フリースクール通所費用の一部を補助	利用料の一部（児童生徒1人あたりの月3万円が上限）	公式HP
北杜市	フリースクール利用支援補助金	市内に住所のある児童生徒	フリースクール等の利用料の一部を補助	利用料の一部（年額・児童生徒1人あたりの月3万円が上限）	公式HP

動画で見る｜不登校・引きこもり・発達障害など学校に合わないすべての子どもが輝く教育機関

家庭でいまできること

制度や相談先が分かっても、明日からどう過ごすかは別の話です。うまくいかない日があって当たり前という前提で、いま無理なくできそうなものだけを選んでください。全部やろうとしないことが、いちばん大事なコツです。

いま家庭で確かめておきたいこと

睡眠のリズムが崩れていないか（起きる時間より、寝る時間を先に整えるほうがうまくいきます）

食事が極端に減っていないか。体重の変化はないか

頭痛・腹痛・立ちくらみなど、体の訴えが続いていないか（続く場合は受診を検討してください）

「学校の話」以外で笑える時間が、1日に少しでもあるか

保護者自身が眠れているか。抱え込んでいないか

学校との連絡窓口が、担任1人に集中していないか

声のかけ方で迷ったときは

「なんで行けないの」と理由を問うと、子ども自身も説明できないことが多く、答えられない自分を責めてしまいます。理由を聞くより、いまの状態を言葉にして返すほうが伝わります。「しんどそうだね」「今日はゆっくりでいいよ」——それだけで十分な日があります。

逆に、避けたほうがよい言葉もあります。「みんな行ってるよ」「そんなことでどうするの」「甘えてるだけでしょ」。どれも本人がすでに自分に言っている言葉なので、外から重ねると逃げ場がなくなります。

相談先の選び方｜どこに何を聞けるか

相談先はひとつではありません。それぞれ役割が違うので、聞きたい内容で選ぶと早く進みます。

相談先の比較
相談先	聞けること	費用	向いている場面
在籍校（担任・スクールカウンセラー）	出席の扱い、校内の別室、学習の進め方	無料	まず学校での配慮を相談したいとき
教育支援センター（市区町村）	学校外の公的な居場所、通所と出席扱い	原則無料	学校の外に一歩を踏み出したいとき
フリースクール（民間）	体験活動中心の居場所、少人数の学び	月1〜5万円程度	興味や「やってみたい」から入りたいとき
オンライン	自宅から参加できる学び、出席扱いの実務	スクールにより異なる	外に出るのが難しい／近くに選択肢がないとき
医療機関（小児科・児童精神科）	体の不調の背景、診断と治療	保険診療	睡眠・食事・体の症状が続くとき
24時間子供SOSダイヤル	子ども本人・保護者どちらの相談も	無料・24時間	いますぐ誰かに聞いてほしいとき（0120-0-78310）

どこから始めればいいか迷ったら

まずは市区町村の教育委員会（教育相談室）に電話してみてください。学校を通さずに保護者から直接相談できる自治体がほとんどです。「今すぐ通える場所はありますか」「対象は何年生からですか」の2つを聞くだけでも、次の一手が見えてきます。全国の窓口は文部科学省のページから探せます。

学校に伝えるときの文例

言いたいことは決まっていても、いざ書こうとすると手が止まる——という声をよく聞きます。そのまま使える形にしました。丁寧すぎる必要はありません。事実と、してほしいことが伝われば十分です。

① しばらく休むことを伝える

いつもお世話になっております。◯年◯組の◯◯の保護者です。
本人の体調と気持ちの状態から、しばらく学校をお休みさせていただきます。
毎朝のご連絡が負担になっているため、こちらから連絡がない日は欠席としてお取り扱いいただけますでしょうか。状況が変わりましたら、その都度ご連絡いたします。

毎朝の欠席連絡は、家庭にとっても学校にとっても負担です。先にこの一文で合意しておくと、朝の消耗がなくなります。多くの学校が対応してくれます。

② 配慮をお願いする

◯◯は、教室の人数と音の多さで疲れてしまうことが多いようです。
つきましては、登校できた日は保健室や別室で過ごさせていただくことは可能でしょうか。
また、給食の時間だけ別室にする、掃除の時間は無理をさせない、といった形でもかまいません。
本人が続けられる形を一緒に考えていただけると助かります。

「配慮してください」だけでは学校も動きにくいので、場面と具体的な対処をセットで書くのがコツです。診断名は必須ではありません。

③ 出席扱いについて相談する

学校外での学びについてご相談させてください。
文部科学省の「不登校児童生徒への支援の在り方について（通知）」（令和元年10月25日）に、学校外の施設で相談・指導を受けた場合や、自宅でICT等を活用した学習を行った場合の指導要録上の出席扱いについて定めがあると伺いました。
本校ではどのような運用になっていますでしょうか。また、要件を満たすために家庭で用意すべきものがあれば教えてください。

ポイントは「認めてください」ではなく「何を用意すればよいですか」と聞くことです。学校側も判断材料を求めています。要件の全文は教育支援センターとはの記事に原文どおり掲載しています。

④ 面談のあとに送る確認メール

本日はお時間をいただきありがとうございました。
確認させていただいた内容を念のためお送りします。
・当面は◯◯（別室／午後のみなど）で対応いただく
・◯◯（教育支援センター等）への通所を検討し、決まり次第ご連絡する
・出席の取り扱いについては、◯月◯日までにご回答いただく
認識に相違がありましたらお知らせください。

口頭の合意は、担任が変わると消えてしまいます。短くていいので記録に残しておくと、翌年度も引き継がれます。学校側にとっても助かる手順です。

伝える相手の順番

担任で止まっていると感じたら、学年主任 → 生徒指導主事 → 教頭・校長 → 市区町村の教育委員会（教育相談室）の順に相談先を上げてください。感情的にならず、これまでの経緯と依頼内容を時系列で整理して伝えるのが最短です。全国の窓口は文部科学省のページから探せます。

まぎらわしい用語の整理

不登校について調べていると、似た名前の制度がいくつも出てきて混乱しがちです。いちばん多い誤解は「教育支援センター」と「学びの多様化学校」を同じものだと思ってしまうことです。前者は在籍校に籍を置いたまま通う「施設」、後者は転校して在籍する「学校」で、まったく別物です。

似ているけれど別物の制度
用語	正体	在籍	費用	出席の扱い
教育支援センター（＝適応指導教室）	市区町村の教育委員会が運営する施設	在籍校のまま	原則無料	要件を満たせば出席扱い
校内教育支援センター（＝校内の別室）	在籍校の中に置かれた部屋	在籍校のまま	無料	出席として扱われる
学びの多様化学校（旧・不登校特例校）	特別の教育課程を組める正式な学校（全国84校）	その学校に転校	公立は無償／私立は学費	通常の出席
フリースクール	NPOや民間企業が運営する民間施設	在籍校のまま	月1〜5万円程度	要件を満たせば出席扱い
オンラインスクール	自宅から参加する民間のスクール	在籍校のまま	スクールにより異なる	自宅ICT学習の要件を満たせば可
通信制高校・サポート校	高校段階の学校と、その学習を支える施設	その高校に在籍	学校により異なる	高校の在籍として扱われる

この表でとくに見ておきたいのは「在籍」の列です。転校が必要かどうかで、手続きも心の準備もまったく変わります。教育支援センターやフリースクールは在籍校に籍を残したまま通えるので、「合わなければ戻る」ことができます。

名前が違っても中身は同じことがあります

とくに教育支援センターは、自治体ごとに「適応指導教室」「ふれあい教室」「ゆうゆう広場」「チャレンジ学級」などさまざまな愛称がついています。お住まいの市区町村で見つからないときは「◯◯市適応指導教室」「◯◯市教育相談不登校」でも検索してみてください。それでも出てこなければ、市区町村の教育委員会（教育相談室）に電話するのが最短です。全国の窓口は文部科学省のページにまとまっています。