【最新版】近畿(大阪・京都・兵庫・三重・滋賀)地方のフリースクール助成金・補助金一覧|不登校のフリースクール利用料を抑える方法

※本記事の内容・金額は、2025年12月時点で各自治体のホームページを確認した情報をもとにしています。最新情報は必ず各自治体の公式サイトでご確認ください。

不登校の子どもが増える中で、学校以外の学び場としてフリースクールを利用する家庭が全国的に増えています。
しかし、通学費や利用料は家庭の負担が大きく、「できれば公的な補助制度を使いたい」と考える保護者は少なくありません。

実は近年、自治体が独自にフリースクール利用を支援する制度が少しずつ増えてきています。ただし、その内容や金額、対象は地域ごとに大きく異なり、制度の存在が分かりにくいのが現状です。

本記事では、近畿地方の自治体を中心に、フリースクール利用者が利用できる助成金や支援制度を整理して一覧化しました。

「自分の地域には支援があるの?」「どんな補助が対象なの?」
そんな疑問を持つ保護者の方が、必要な制度にスムーズにたどり着けるように、できる限り最新情報をまとめています。

フリースクール 助成金(補助金)」「フリースクール 補助」「不登校 利用料」などで検索している方の、情報収集の手間を少しでも減らすことができれば嬉しいです。

目次

【最新版】近畿地方のフリースクール助成金・補助金一覧

ここでは、近畿地方のうち、実際にフリースクールの利用料や通所に対する助成金・補助金制度が確認できた自治体をまとめています。

各自治体ごとの「対象」「金額のイメージ」「リンク」を一覧からチェックできますのでご確認ください。

※補助金額は「上限額」や「何割を補助」など自治体ごとに細かな条件があります。あくまで目安として記載し、詳細は必ず公式HPをご覧ください

大阪府

自治体名 対象者詳細リンク
大阪市大阪市内居住している小学5年生中学3年生養育している大阪市習い事・塾代助成事業
泉佐野市泉佐野市に住民登録されている小学5年生から中学3年生まで
※所得制限基準があります
泉佐野市塾代等助成事業
泉南郡岬町岬町立小中学校に在籍し、かつ、岬町に住所を有する者泉南郡岬町ウェブサイト

※大阪市はNIJINアカデミーの生徒利用実績あり

兵庫県

自治体名 対象者詳細リンク
姫路市不登校児童生徒が、フリースクール等利用開始時点において、姫路市内に住所を有している姫路市ウェブサイト
尼崎市対象となる不登校児童生徒が、尼崎市内に居住している(フリースクール等利用時点)尼崎市ウェブサイト
明石市市内在住もしくは明石市立小中養護学校に学籍のある児童生徒の保護者明石市教育委員会
加古川市加古川市内に在住している、加古川市立の小学校、中学校、義務教育学校、特別支援学校に在籍している加古川市教育委員会
三田市対象となる不登校児童生徒が、市内に住所を有し、市立の小学校又は中学校に在籍すること三田市ウェブサイト
豊岡市豊岡市立小・中・義務教育学校に在籍し、かつ、豊岡市内に住所を有している豊岡市ウェブサイト
三木市フリースクール等利用時点において、三木市内に住所を有している児童生徒の保護者三木市ウェブサイト
加東市児童生徒の保護者等で、本市の住民基本台帳に記録され市内に居住しているもの加東市ウェブサイト
加古郡稲美町補助金の申請日前1年の期間内におおむね30日以上在籍学校に登校していない児童生徒の保護者加古郡稲美町ウェブサイト
神崎郡神河町神河町立小中学校に在籍し、かつ、町内に住所を有していること神崎郡神河町ウェブサイト

※姫路市、尼崎市はNIJINアカデミーの生徒利用実績あり

京都府

自治体名 対象者詳細リンク
亀岡市市税を滞納していないこと亀岡市ウェブサイト

三重県

自治体名対象者詳細リンク
三重県県教育委員会が定めた要件を満たすフリースクールを利用しようとする児童生徒等がいる世帯で経済的な事情のある世帯三重県ウェブサイト
伊賀市市内に住所を有し、伊賀市立の小学校または中学校に在籍する児童生徒の保護者伊賀市ウェブサイト

滋賀県

自治体名対象者詳細リンク
大津市本市に住所を有する者大津市ウェブサイト
草津市申請のあった日の前1年以内に、おおむね30日以上在籍する学校に登校していない児童生徒の保護者草津市ウェブサイト
彦根市彦根市内に住所を有する者彦根市ウェブサイト
長浜市長浜市立小学校、中学校又は義務教育学校に在籍する児童生徒の保護者長浜市ウェブサイト
東近江市学校の課業時間内に原則として月1回以上フリースクール等民間施設に通所する児童生徒の保護者東近江市ウェブサイト
甲賀市補助金の申請の日前1年の期間内に概ね30日以上、在籍する学校に登校していない児童生徒の保護者等甲賀市ウェブサイト
守山市市内に住所を有している保護者守山市ウェブサイト
近江八幡市近江八幡市内に住所を有する小・中学生のうち、一定期間学校に登校できずに市長が認めるフリースクール等民間施設を利用する児童生徒の保護者近江八幡市ウェブサイト
栗東市フリースクール等を利用することにより、在籍学校の出席扱いを受けている児童生徒の保護者栗東市ウェブサイト
湖南市申請日前1年の期間内において、在籍する学校を30日以上欠席する不登校児童生徒の保護者等湖南市ウェブサイト
野洲市申請のあった日前1年以内に、おおむね30日以上在籍学校に登校していない不登校児童生徒の保護者野洲市ウェブサイト
高島市申請のあった日前1年以内の期間において、在籍する学校に延べ30日以上出席していない不登校児童生徒の保護者高島市ウェブサイト
米原市フリースクールに通所する市内に住所を有する不登校児童生徒の保護者米原市ウェブサイト
蒲生郡日野町日野町内に住所を有しており、フリースクールを利用する不登校児童生徒の保護者蒲生郡日野町ウェブサイト
愛知郡愛荘町町内に住所を有すること愛知郡愛荘町ウェブサイト
蒲生郡竜王町児童生徒が在籍する学校に、補助金申請日前1年の期間内に原則30日以上登校していない児童生徒の保護者蒲生郡竜王町ウェブサイト
犬上郡多賀町町内に住所を有すること犬上郡多賀町ウェブサイト

※大津市、草津市、守山市、湖南市はNIJINアカデミーの生徒利用実績あり

※奈良県・和歌山県については、上記のように利用者(保護者)へ直接助成金を交付している市町村は現在のところ情報はありません。

補助金を利用するために必要な手続き・申請方法

フリースクールの助成金は、自治体によって申請フローが異なりますが、共通して必要になるのは次の3点です。

① 在籍校(小・中学校)での相談・確認

多くの自治体では、
「学校に30日以上登校が困難」
「在籍校による確認書が必要」
といった条件があるため、まずは学校(担任・生徒指導・教育相談室など)に相談します。

② フリースクール側に必要書類を依頼

申請には、以下のような書類をフリースクール側からもらう必要があります。

  • 利用証明書
  • 月々の領収書
  • フリースクールの概要資料
  • カリキュラムや活動内容の証明

自治体ごとにフォーマットが決まっていることもあります。

③ 市役所・県の教育委員会で申請

窓口はほとんどの場合、
教育委員会/学校教育課/子育て支援課
いずれかです。

申請期限が「年度ごと」「毎月」「利用前に申請」のどれなのかは自治体で大きく違うため、事前確認が必須です。

フリースクール助成金を受けるためのチェックリスト

次の条件に当てはまれば、多くの自治体で助成対象になる可能性があります。

✓ 市内(または県内)に住所がある

住民票の住所で判断されます。

✓ 在籍校への登校が一定期間困難

例:30日以上欠席・継続して不登校状態にある
※自治体の基準により異なる

✓ 家庭で該当のフリースクールに通っている(または通う予定)

認定・選定された団体に限る場合があります。

✓ 他の補助制度と重複利用していない

尼崎市など、併給不可の例あり

✓ 領収書など、必要書類を提出できる

フリースクールから受領した領収書等の整理が必要です。

動画で見る|不登校・引きこもり・発達障害など学校に合わないすべての子どもが輝く教育機関

大阪府で使える公的な支援と相談窓口

民間の教室やスクールを探す前に、大阪府で公的に使える支援を知っておくと、費用も選択肢の幅も変わります。市区町村の教育委員会が運営する教育支援センター(適応指導教室)利用料が原則無料で、通った日は在籍校の出席扱いにできます。

大阪府の小中学校の不登校児童生徒数は23,749人(令和6年度・文部科学省調査)。在籍者に占める割合は約3.79%で、全国平均は約3.86%です。ひとりで抱えている家庭が、それだけ多くあるということでもあります。

大阪府全体の相談窓口

大阪府の広域相談窓口
窓口リンク
大阪府教育センター すこやか教育相談(電話、LINE、面接等)の案内公式ページを見る
子どもを守る被害者救済システム(子ども家庭相談室)公式ページを見る
LACO(大阪府学びのアクセスセンター)公式ページを見る
24時間子供SOSダイヤル(全国共通・無料)0120-0-78310

大阪府内39市区町村の窓口をまとめた一覧は、大阪府の教育支援センター(適応指導教室)一覧にあります。掲載しているリンクはすべて実際にアクセスして到達を確認済みです。

大阪府で相談を始めるときの進め方

どこに何を聞けばいいか分からないまま電話すると、たらい回しになりがちです。順番を決めておくと、1本の電話で話が進みます。

相談の順番

1

① 在籍校か、市区町村の教育相談窓口に連絡する

担任・スクールカウンセラーに伝えるか、大阪府の教育委員会(教育相談室)に保護者から直接電話します。多くの自治体が保護者からの直接相談を受け付けています。

2

② 「今すぐ通えますか」「対象は何年生からですか」を最初に聞く

教育支援センターは定員があり、小4以上を対象とする自治体が多いです。ここを最初に確認すると、次の手を早く打てます。

3

③ 見学・体験から始める

保護者だけの見学から始めても構いません。部屋の雰囲気と、指導員との相性を見てください。

4

④ 出席扱いの扱いを学校と確認する

「別記1(通所)/別記2(自宅ICT学習)の要件を満たすために、こちらで何を用意すればよいでしょうか」と聞きます。「認めてください」ではなく「何を用意すればよいか」のほうが通ります。

費用の負担を軽くする制度

  • 教育支援センターは利用料が原則無料(教材費・昼食・交通費は自己負担の場合あり)
  • 就学援助(学用品費・給食費などの補助)は、大阪府の教育委員会が窓口です
  • フリースクール利用料の補助制度を設けている自治体も増えています。大阪府に制度があるか、教育委員会に直接お問い合わせください

家庭でいまできること

制度や相談先が分かっても、明日からどう過ごすかは別の話です。うまくいかない日があって当たり前という前提で、いま無理なくできそうなものだけを選んでください。全部やろうとしないことが、いちばん大事なコツです。

いま家庭で確かめておきたいこと

睡眠のリズムが崩れていないか(起きる時間より、寝る時間を先に整えるほうがうまくいきます)

食事が極端に減っていないか。体重の変化はないか

頭痛・腹痛・立ちくらみなど、体の訴えが続いていないか(続く場合は受診を検討してください)

「学校の話」以外で笑える時間が、1日に少しでもあるか

保護者自身が眠れているか。抱え込んでいないか

学校との連絡窓口が、担任1人に集中していないか

声のかけ方で迷ったときは

「なんで行けないの」と理由を問うと、子ども自身も説明できないことが多く、答えられない自分を責めてしまいます。理由を聞くより、いまの状態を言葉にして返すほうが伝わります。「しんどそうだね」「今日はゆっくりでいいよ」——それだけで十分な日があります。

逆に、避けたほうがよい言葉もあります。「みんな行ってるよ」「そんなことでどうするの」「甘えてるだけでしょ」。どれも本人がすでに自分に言っている言葉なので、外から重ねると逃げ場がなくなります。

相談先の選び方|どこに何を聞けるか

相談先はひとつではありません。それぞれ役割が違うので、聞きたい内容で選ぶと早く進みます。

相談先の比較
相談先聞けること費用向いている場面
在籍校(担任・スクールカウンセラー)出席の扱い、校内の別室、学習の進め方無料まず学校での配慮を相談したいとき
教育支援センター(市区町村)学校外の公的な居場所、通所と出席扱い原則無料学校の外に一歩を踏み出したいとき
フリースクール(民間)体験活動中心の居場所、少人数の学び月1〜5万円程度興味や「やってみたい」から入りたいとき
オンライン自宅から参加できる学び、出席扱いの実務スクールにより異なる外に出るのが難しい/近くに選択肢がないとき
医療機関(小児科・児童精神科)体の不調の背景、診断と治療保険診療睡眠・食事・体の症状が続くとき
24時間子供SOSダイヤル子ども本人・保護者どちらの相談も無料・24時間いますぐ誰かに聞いてほしいとき(0120-0-78310)

どこから始めればいいか迷ったら

まずは市区町村の教育委員会(教育相談室)に電話してみてください。学校を通さずに保護者から直接相談できる自治体がほとんどです。「今すぐ通える場所はありますか」「対象は何年生からですか」の2つを聞くだけでも、次の一手が見えてきます。全国の窓口は文部科学省のページから探せます。

この記事のテーマについて、よく寄せられる質問

同じような状況の方から実際によく届く質問をまとめました。あてはまるものから読んでください。

Q. 欠席が多いと高校に行けませんか?

A. 行けます。出席日数を選抜に使わない高校は増えており、通信制高校では欠席日数を問わないところがほとんどです。中学校卒業程度認定試験や高等学校卒業程度認定試験という道もあります。

Q. フリースクールに通うと出席扱いになりますか?

A. 要件を満たせば校長の判断で出席扱いにできます。ただし文部科学省の通知では教育支援センター等の公的機関が第一に想定されており、民間施設は「公的機関に通えない場合」に考慮される位置づけです。詳しくは教育支援センターとはをご覧ください。

Q. 費用が心配です

A. 教育支援センター原則無料です。民間のフリースクールについては、利用料の補助制度を設けている自治体が増えています。就学援助もあわせて教育委員会に確認してください。

Q. 学校に戻ることを目標にしなくていいのですか?

A. はい。文部科学省の通知が「『学校に登校する』という結果のみを目標にするのではなく、社会的に自立することを目指す」と明記しています。学校復帰は選択肢のひとつであって、唯一のゴールではありません。

Q. 近くに通える場所がありません

A. ①校内の別室、②教育支援センターの訪問型支援、③自宅でのICT学習を出席扱いにする道(別記2)、④オンライン——の順で確認するのが現実的です。地域に選択肢がないことは、家庭の責任ではありません。

つらいときの相談先(24時間・無料)

  • 24時間子供SOSダイヤル:0120-0-78310(全国どこからでも、24時間・無料。子ども本人も保護者も利用できます)
  • お住まいの市区町村の教育委員会 教育相談室/教育センター

この記事は情報提供であり、医療的・心理的な診断や個別の助言に代わるものではありません。心身の不調が続く場合は、かかりつけ医やスクールカウンセラーにご相談ください。

Q. 大阪府の教育支援センターは無料ですか?

A. 利用料は原則無料です。市区町村の教育委員会が運営する公的機関のためです。ただし教材費・体験活動の材料費・昼食・交通費は自己負担になることがあります。給食がない施設が多く、弁当持参が一般的です。

Q. 大阪府で通える場所がない場合はどうすればいいですか?

A. ①在籍校の校内別室(保健室登校を含む)を確認する、②訪問型支援があるか窓口で聞く、③自宅でのICT学習を出席扱いにする道(別記2)を学校と相談する、④オンラインを検討する——の順で当たるのが現実的です。大阪府の状況によっては、通える範囲に施設がないこともあります。

Q. 学校を休ませてもいいのでしょうか?

A. 教育機会確保法の第13条は、「個々の不登校児童生徒の休養の必要性を踏まえ」と条文で明記しています。休むことは制度の外側にある逸脱ではなく、法律が想定している状態です。文部科学省の通知も「『学校に登校する』という結果のみを目標にするのではなく」と述べています。

よくある質問(FAQ)

Q1. どんなフリースクールでも補助対象になりますか?

A. いいえ。自治体が「認定」「選定」したフリースクールのみ対象という場合が多いです。

Q2. オンラインのフリースクールも補助になりますか?

A. 一部自治体では対象になります。
例:大阪市などはオンライン利用も可能。

Q3. 高校生も対象になりますか?

A. 多くは小中学生が対象。

Q4. 毎月申請が必要ですか?

A. 自治体により異なります。
月ごと・半年ごと・年度単位などさまざまです。

まとめ:地域の制度を正しく活用して、子どもの学びを支える

フリースクールの助成金は、全国的に増えてきているとはいえ、まだ制度が整っている自治体は一部に限られます。
市町村ごとに大きな差があり、「知らなければ利用できなかった」というケースも多くあります。

本記事で紹介した制度は、保護者の不安を減らし、子どもの学びを継続するための大切なサポートです。

  • まずは自分の自治体に制度があるか確認する
  • 学校・フリースクールと連携して申請を進める
  • 必要な書類をそろえ、期限内に手続きを行う

これらを押さえれば、負担を大きく減らしながら、より良い学びの環境を整えることができます。


NIJINアカデミーは全国各地でリアル校(通所型の校舎)を開校しているため、「通所型フリースクール」が要件となっている自治体の補助金でも、条件を満たせるケースがあります。

「うちの地域の制度で、どんな利用の仕方ができそうか」「通所とオンラインをどう組み合わせるか」など、

具体的なイメージを持つためにも、まずは一度体験会で雰囲気を感じてみてください。

近畿地方にあるNIJINアカデミーリアル教室

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